MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Streptococcus suis D12 chromosome

Total Repeats: 37167

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017621	AAC	2	6	11	16	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386585203
2	NC_017621	T	6	6	17	22	0 %	100 %	0 %	0 %	386585203
3	NC_017621	A	6	6	148	153	100 %	0 %	0 %	0 %	386585203
4	NC_017621	A	7	7	164	170	100 %	0 %	0 %	0 %	386585203
5	NC_017621	AAG	2	6	279	284	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386585203
6	NC_017621	CTC	2	6	323	328	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386585203
7	NC_017621	AAT	2	6	400	405	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386585203
8	NC_017621	ATT	2	6	465	470	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386585203
9	NC_017621	TGG	2	6	477	482	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386585203
10	NC_017621	TCA	2	6	581	586	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386585203
11	NC_017621	A	7	7	631	637	100 %	0 %	0 %	0 %	386585203
12	NC_017621	ACTT	2	8	653	660	25 %	50 %	0 %	25 %	386585203
13	NC_017621	TGA	2	6	666	671	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386585203
14	NC_017621	TC	3	6	679	684	0 %	50 %	0 %	50 %	386585203
15	NC_017621	TAA	2	6	687	692	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386585203
16	NC_017621	CAA	2	6	695	700	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386585203
17	NC_017621	GAA	2	6	706	711	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386585203
18	NC_017621	A	7	7	740	746	100 %	0 %	0 %	0 %	386585203
19	NC_017621	GAA	2	6	799	804	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386585203
20	NC_017621	CTATC	2	10	928	937	20 %	40 %	0 %	40 %	386585203
21	NC_017621	ACGT	2	8	959	966	25 %	25 %	25 %	25 %	386585203
22	NC_017621	TGC	2	6	1041	1046	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386585203
23	NC_017621	CG	3	6	1188	1193	0 %	0 %	50 %	50 %	386585203
24	NC_017621	GACA	2	8	1224	1231	50 %	0 %	25 %	25 %	386585203
25	NC_017621	ATGC	2	8	1285	1292	25 %	25 %	25 %	25 %	386585203
26	NC_017621	AATAA	2	10	1297	1306	80 %	20 %	0 %	0 %	386585203
27	NC_017621	CTC	2	6	1312	1317	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386585203
28	NC_017621	GAT	2	6	1321	1326	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386585203
29	NC_017621	A	6	6	1356	1361	100 %	0 %	0 %	0 %	386585203
30	NC_017621	TAA	2	6	1545	1550	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386585204
31	NC_017621	AT	3	6	1553	1558	50 %	50 %	0 %	0 %	386585204
32	NC_017621	A	6	6	1599	1604	100 %	0 %	0 %	0 %	386585204
33	NC_017621	TTA	2	6	1772	1777	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386585204
34	NC_017621	AAG	2	6	1880	1885	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386585204
35	NC_017621	ACAA	2	8	1956	1963	75 %	0 %	0 %	25 %	386585204
36	NC_017621	GTC	2	6	2000	2005	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386585204
37	NC_017621	TGA	2	6	2115	2120	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386585204
38	NC_017621	TGT	2	6	2127	2132	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386585204
39	NC_017621	TC	3	6	2146	2151	0 %	50 %	0 %	50 %	386585204
40	NC_017621	GAT	2	6	2176	2181	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386585204
41	NC_017621	TCT	2	6	2198	2203	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386585204
42	NC_017621	AAT	2	6	2209	2214	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386585204
43	NC_017621	TTA	2	6	2257	2262	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386585204
44	NC_017621	TACC	2	8	2268	2275	25 %	25 %	0 %	50 %	386585204
45	NC_017621	AAC	2	6	2310	2315	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386585204
46	NC_017621	TCT	2	6	2364	2369	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386585204
47	NC_017621	TAA	2	6	2412	2417	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386585204
48	NC_017621	TGT	2	6	2418	2423	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386585204
49	NC_017621	ACTT	2	8	2521	2528	25 %	50 %	0 %	25 %	386585204
50	NC_017621	TCT	2	6	2581	2586	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386585204
51	NC_017621	GTCC	2	8	2587	2594	0 %	25 %	25 %	50 %	386585204
52	NC_017621	AAT	2	6	2611	2616	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386585204
53	NC_017621	TA	4	8	2763	2770	50 %	50 %	0 %	0 %	386585205
54	NC_017621	CTG	2	6	2799	2804	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386585205
55	NC_017621	CATAT	2	10	2807	2816	40 %	40 %	0 %	20 %	386585205
56	NC_017621	AAAG	2	8	2825	2832	75 %	0 %	25 %	0 %	386585205
57	NC_017621	A	6	6	2883	2888	100 %	0 %	0 %	0 %	386585205
58	NC_017621	AGT	2	6	2921	2926	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386585205
59	NC_017621	TTA	2	6	3007	3012	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386585205
60	NC_017621	TA	3	6	3063	3068	50 %	50 %	0 %	0 %	386585205
61	NC_017621	AT	3	6	3107	3112	50 %	50 %	0 %	0 %	386585205
62	NC_017621	A	7	7	3203	3209	100 %	0 %	0 %	0 %	386585205
63	NC_017621	ATT	2	6	3265	3270	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386585205
64	NC_017621	TGA	2	6	3304	3309	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386585205
65	NC_017621	T	6	6	3335	3340	0 %	100 %	0 %	0 %	386585205
66	NC_017621	TGG	2	6	3367	3372	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386585205
67	NC_017621	GAAG	2	8	3409	3416	50 %	0 %	50 %	0 %	386585205
68	NC_017621	TTA	2	6	3476	3481	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386585205
69	NC_017621	TCT	2	6	3497	3502	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386585205
70	NC_017621	ATT	3	9	3556	3564	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386585205
71	NC_017621	GA	3	6	3576	3581	50 %	0 %	50 %	0 %	386585205
72	NC_017621	GTAT	2	8	3624	3631	25 %	50 %	25 %	0 %	386585205
73	NC_017621	GTAT	2	8	3645	3652	25 %	50 %	25 %	0 %	386585206
74	NC_017621	TCA	2	6	3696	3701	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386585206
75	NC_017621	AAG	2	6	3713	3718	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386585206
76	NC_017621	TGT	2	6	3784	3789	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386585206
77	NC_017621	ATG	2	6	3791	3796	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386585206
78	NC_017621	CAA	2	6	3969	3974	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386585207
79	NC_017621	TTG	2	6	4168	4173	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386585207
80	NC_017621	AAC	2	6	4177	4182	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386585207
81	NC_017621	AATG	2	8	4190	4197	50 %	25 %	25 %	0 %	386585207
82	NC_017621	GAA	2	6	4215	4220	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386585207
83	NC_017621	CT	3	6	4263	4268	0 %	50 %	0 %	50 %	386585207
84	NC_017621	CAG	2	6	4441	4446	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386585208
85	NC_017621	TCG	2	6	4450	4455	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386585208
86	NC_017621	TGG	2	6	4558	4563	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386585208
87	NC_017621	TCA	2	6	4600	4605	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386585208
88	NC_017621	AAAT	2	8	4691	4698	75 %	25 %	0 %	0 %	386585208
89	NC_017621	TTG	2	6	4795	4800	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386585208
90	NC_017621	AG	3	6	4853	4858	50 %	0 %	50 %	0 %	386585208
91	NC_017621	CAA	2	6	4862	4867	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386585208
92	NC_017621	A	6	6	4885	4890	100 %	0 %	0 %	0 %	386585208
93	NC_017621	A	6	6	4942	4947	100 %	0 %	0 %	0 %	386585208
94	NC_017621	AGA	2	6	4961	4966	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386585208
95	NC_017621	GAA	2	6	5001	5006	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386585208
96	NC_017621	A	6	6	5008	5013	100 %	0 %	0 %	0 %	386585208
97	NC_017621	GTG	3	9	5151	5159	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386585208
98	NC_017621	GAA	3	9	5175	5183	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386585208
99	NC_017621	CGA	2	6	5195	5200	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386585208
100	NC_017621	CTTG	2	8	5279	5286	0 %	50 %	25 %	25 %	386585208
101	NC_017621	ACTT	2	8	5295	5302	25 %	50 %	0 %	25 %	386585208
102	NC_017621	GTGC	2	8	5322	5329	0 %	25 %	50 %	25 %	386585208
103	NC_017621	CTC	2	6	5356	5361	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386585208
104	NC_017621	TAT	2	6	5372	5377	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386585208
105	NC_017621	ATG	2	6	5425	5430	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386585208
106	NC_017621	GAA	2	6	5484	5489	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386585208
107	NC_017621	CAT	2	6	5519	5524	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386585208
108	NC_017621	A	6	6	5699	5704	100 %	0 %	0 %	0 %	386585209
109	NC_017621	ATC	2	6	5716	5721	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386585209
110	NC_017621	AAACA	2	10	5753	5762	80 %	0 %	0 %	20 %	386585209
111	NC_017621	TGC	2	6	5777	5782	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386585209
112	NC_017621	A	6	6	5870	5875	100 %	0 %	0 %	0 %	386585209
113	NC_017621	TCTA	2	8	5876	5883	25 %	50 %	0 %	25 %	386585209
114	NC_017621	TTA	2	6	5940	5945	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386585209
115	NC_017621	TAG	2	6	5969	5974	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386585209
116	NC_017621	GAC	2	6	5980	5985	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386585209
117	NC_017621	TGG	2	6	6033	6038	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386585209
118	NC_017621	TGTCT	2	10	6144	6153	0 %	60 %	20 %	20 %	386585209
119	NC_017621	GAA	2	6	6229	6234	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386585209
120	NC_017621	GAT	2	6	6235	6240	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386585209
121	NC_017621	ATCA	2	8	6309	6316	50 %	25 %	0 %	25 %	386585210
122	NC_017621	TAT	2	6	6352	6357	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386585210
123	NC_017621	ATG	2	6	6448	6453	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386585210
124	NC_017621	AGC	2	6	6476	6481	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386585210
125	NC_017621	ATT	2	6	6483	6488	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386585210
126	NC_017621	T	6	6	6510	6515	0 %	100 %	0 %	0 %	386585210
127	NC_017621	GAT	2	6	6519	6524	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386585210
128	NC_017621	GTTT	2	8	6539	6546	0 %	75 %	25 %	0 %	386585210
129	NC_017621	TCAA	2	8	6566	6573	50 %	25 %	0 %	25 %	386585210
130	NC_017621	GTT	2	6	6624	6629	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386585210
131	NC_017621	GCT	2	6	6636	6641	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386585210
132	NC_017621	A	6	6	6756	6761	100 %	0 %	0 %	0 %	386585210
133	NC_017621	T	6	6	6855	6860	0 %	100 %	0 %	0 %	386585210
134	NC_017621	GAGAT	2	10	6862	6871	40 %	20 %	40 %	0 %	386585210
135	NC_017621	TC	3	6	6937	6942	0 %	50 %	0 %	50 %	386585210
136	NC_017621	AGA	2	6	6968	6973	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386585210
137	NC_017621	TAG	2	6	6977	6982	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386585210
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268	NC_017621	AGGC	2	8	12898	12905	25 %	0 %	50 %	25 %	386585215
269	NC_017621	TAA	2	6	12920	12925	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386585215
270	NC_017621	TAAA	2	8	12932	12939	75 %	25 %	0 %	0 %	386585215
271	NC_017621	A	6	6	12937	12942	100 %	0 %	0 %	0 %	386585215
272	NC_017621	CCG	2	6	12945	12950	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386585215
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275	NC_017621	A	6	6	13068	13073	100 %	0 %	0 %	0 %	386585215
276	NC_017621	TA	4	8	13094	13101	50 %	50 %	0 %	0 %	386585215
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283	NC_017621	GTT	2	6	13529	13534	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386585216
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293	NC_017621	A	6	6	16386	16391	100 %	0 %	0 %	0 %	386585217
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302	NC_017621	TGA	2	6	23721	23726	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386585218
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390	NC_017621	CT	3	6	27644	27649	0 %	50 %	0 %	50 %	386585222
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392	NC_017621	TGCC	2	8	27720	27727	0 %	25 %	25 %	50 %	386585222
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